Το Λαογραφικό Μουσείο και Αρχείο στεγάζεται στον παλαιό χώρο του Σπουδαστηρίου Λαογραφίας (είσοδος 734, 7ος όροφος), με το οποίο ήταν άρρηκτα συνδεδεμένο. Η δημιουργία των συλλογών του ξεκίνησε το 1965 ως «Αρχείο Χειρογράφων Πρωτογενούς Λαογραφικής Ύλης» με προσηρτημένη «Λαογραφική Μουσειακή Συλλογή». Σήμερα αριθμεί 4.000 περίπου χειρόγραφα πρωτογενούς λαογραφικού υλικού από την Ελλάδα, την Κύπρο και την ελληνική διασπορά που αφορούν καταγραφές των ποικίλων εκφάνσεων του ελληνικού λαϊκού πολιτισμού, στο γλωσσικό ιδίωμα των πληροφορητών τους. Οι χειρόγραφες αυτές συλλογές, έχουν υποβληθεί από φοιτήτριες και φοιτητές της Φιλοσοφικής Σχολής ως εργασία στα μαθήματα της Λαογραφίας. Στο μεγαλύτερο μέρος τους έχουν ψηφιοποιηθεί και είναι διαθέσιμες στο ευρύ κοινό μέσα από το Ολοκληρωμένο Σύστημα Ψηφιακής Βιβλιοθήκης “Πέργαμος”. Προπτυχιακοί και μεταπτυχιακοί φοιτητές, διδάκτορες και καθηγητές αλλά και εν γένει ερευνητές από την Ελλάδα και το εξωτερικό συμπληρώνουν τις έρευνές τους κάνοντας χρήση αυτού του σημαντικού αρχείου, δεύτερο σε μέγεθος λαογραφικού αρχείου στην Ελλάδα.